Kurtuluş Savaşı sırasında Büyük Taarruzun başlamasıyla birlikte geriye çekilmeye başlayan yunan kuvvetleri 3 yıldır işgal ettikleri bölgelerde Camileri,İstasyonları yakmış vatandaşın evlerini ateşe vermişti.Anadoluya büyük zarar veren yunanlılar Döğer den kaçarken de İstasyon veDöğer Ulu camiyi yakmışlardı.Ulu cami yakıldıktan sonra tekrar tamir edilerek 1925 yılında namaz kılınmaya başlandı.
Ulu caminin tarihi daha da eskilere dayanıyor.1434 Yılında 2.Murat tarafından Döğer Kervansarayınınbir bölümü yaptırılmış, daha sonra diğer bölümü tamamlanmıştı.Bir çok kervanın uğrak yeri olan Döğer Kervansarayı Yavuz Sultan Selim Hanı da misafir etmişti.O Dönemlerde birde Döğer mevkisinde camii ihtiyacı vardı.Bu Camii ihtiyacı Kervansarayın yapılışından sonra 15-16 yy arası tamamlandı.Tabi bu kadar uzun bir tarihi olan Ulu caminin Eskiye dair belgelerine ise malesef yangından sonra ulaşılamadı.Döğer Ulu camiinde şimdiye kadar en uzun süre Gazi Alaattin Mutlu ve Merhum Tevfik Bilim görev yaptı.İlk müezzin ise 2014 yılında atandı.